Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad6O35182 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad6O35182 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad6O35182 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms