Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grcc10O35127 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms