Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hps1O08983 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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