Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Barx2O08686 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms