Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms