Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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