Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms