Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8298J3QPI0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms