Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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