Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm21818J3KMS6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm21818J3KMS6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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