Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms