Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdh9F8VPK8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms