Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Igkv1-99F6XWB2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms