Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms