Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms