Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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