Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms