Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms