Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms