Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SafbD3YXK2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms