Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Phf11bB4XVQ1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Phf11bB4XVQ1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Phf11bB4XVQ1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Phf11bB4XVQ1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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