Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms