Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NhsB1AV60 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms