Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms