Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms