Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms