Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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