Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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