Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms