Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms