Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hivep3A2A884 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms