Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5538W4VSP6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5538W4VSP6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5538W4VSP6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5538W4VSP6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5538W4VSP6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms