Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms