Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms