Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms