Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdpk1Q9Z2A0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms