Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms