Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms