Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms