Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms