Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50aQ9WV03 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms