Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms