Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn3Q9WUK7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn3Q9WUK7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn3Q9WUK7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms