Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms