Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms