Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hic1Q9R1Y5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms