Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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