Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Col4a4Q9QZR9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Col4a4Q9QZR9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Col4a4Q9QZR9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Col4a4Q9QZR9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Col4a4Q9QZR9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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