Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms