Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn8Q9QZ49 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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